Ce qui était le seul territoire du Portugal encore dans la zone "orange" est désormais couvert de "rouge" (ce qui signifie "risque élevé") dans les cartes d'indicateurs combinés de l'ECDC, qui couvrent les taux de notification des cas au cours des 14 derniers jours, le nombre de tests effectués et le nombre total de positifs, et qui sont mises à jour chaque semaine le jeudi.

La catégorie "rouge" signifie que, dans ces régions européennes, le taux cumulé de notification des cas d'infection au cours des 14 derniers jours se situe entre 75 et 200 pour 100 000 habitants ou est supérieur à 200 et inférieur à 500 pour 100 000 habitants et que le taux de positivité des tests est de 4 % ou plus.

Auparavant, Madère se trouvait dans la catégorie "orange" (catégorie faisant référence aux territoires où le taux de notification de nouvelles infections est compris entre 50 et 75 pour 100 000 habitants au cours des 14 derniers jours ou entre 75 et 200 pour 100 000 habitants et où le taux de positivité des tests est de 1 % ou de 4 % ou plus, respectivement), après avoir atteint la catégorie "verte" (moins de 50 nouveaux cas et un taux de positivité inférieur à 4 %, ou moins de 75 cas mais avec un taux de positivité inférieur à 1 %).

À la mi-juillet, le Portugal continental était entièrement couvert de "rouge" sur ces cartes de l'ECDC, à l'exception de Madère et des Açores, ce dernier archipel étant passé quelques jours plus tard dans la catégorie "risque élevé". En février, et en raison du nombre élevé d'infections, le Portugal figurait même dans la catégorie "rouge foncé" des cartes de l'ECDC, utilisée pour les zones où le virus circule à des niveaux très élevés, la pire de toutes.

Ces cartes de l'agence européenne suivent un système de feux de signalisation sur la propagation du covid-19 dans l'UE, en commençant par le vert (situation favorable), en passant par l'orange, le rouge et le rouge foncé (ce qui signifie que la situation est très dangereuse).Elles servent d'aide aux États membres sur les restrictions à appliquer aux déplacements au sein de la Communauté. À la mi-juin, le Conseil de l'UE a adopté une recommandation pour une approche coordonnée des déplacements, proposant que les personnes vaccinées et guéries du covid-19 ne soient pas soumises à des mesures restrictives telles que des quarantaines ou des tests.