Il Dipartimento di Malattie Infettive dell'Istituto Nazionale della Salute Ricardo Jorge (INSA) ha già analizzato 13.256 sequenze del genoma del nuovo coronavirus, ottenute da campioni raccolti in più di 100 laboratori, ospedali e istituzioni, che rappresentano 297 comuni del Portogallo. "Tra le nuove sequenze analizzate, la variante Delta (B.1.617.2) è la variante più diffusa in Portogallo, con una frequenza del 98,3% nella settimana 29 (dal 19 al 25 luglio), essendo superiore al 95% in tutte le regioni", si legge nella "Relazione sullo stato della diversità genetica del nuovo coronavirus SARS-CoV-2 in Portogallo" pubblicata oggi sul sito dell'INSA .

Secondo i dati, la frequenza relativa della variante Delta in questo periodo è stata del 100 per cento nel Nord, Algarve e Regione Autonoma di Madeira, del 97,6 per cento nel Centro e nelle regioni dell'Alentejo, del 97,2 per cento a Lisbona e Vale do Tejo e del 95 per cento nella Regione Autonoma delle Azzorre. I ricercatori dell'INSA dicono che, del totale delle sequenze di varianti Delta analizzate finora, 62 hanno la mutazione aggiuntiva K417N nella proteina Spike (sottolinea AY.1). "Questa sottolinea ha mantenuto una frequenza relativa inferiore all'1 per cento dalla settimana 24 (14-20 giugno), con sei casi rilevati durante il periodo delle settimane 28 (12-18 e 29 luglio) e 29 (19-25 luglio). )", riferiscono.

Il rapporto sulla diversità genetica della SARS-CoV-2 indica anche che la frequenza relativa delle varianti Beta (B.1.351) e Gamma (P.1), inizialmente associate al Sudafrica e al Brasile (Manaus), rispettivamente, si mantiene bassa e senza una tendenza all'aumento. Entrambi avevano una frequenza di 0,4 per cento alla settimana 29, secondo i dati raccolti fino ad oggi, sottolineano, aggiungendo che non sono stati rilevati nuovi casi della variante Lambda (C.37), che ha segnato la circolazione nelle regioni del Perù e Cile.

Tra le altre varianti di interesse in circolazione in Portogallo, l'INSA evidenzia le varianti B.1.621, inizialmente rilevata in Colombia, e Eta (B.1.525), inizialmente rilevata in Nigeria, che hanno mutazioni nella proteina Spike, che sono condivise con alcune delle varianti preoccupanti. Queste varianti hanno una bassa frequenza in Portogallo, essendo state rilevate sotto lo 0,8% (B.1.621) o lo 0,3% (Eta B.1.525) dalla settimana 25 (21-27 giugno), afferma il documento.

Come parte del monitoraggio continuo della diversità genetica della SARS-CoV-2 che l'INSA sta sviluppando, una media di 601 sequenze a settimana è stata analizzata dall'inizio di giugno 2021. Questo campionamento ha coinvolto laboratori distribuiti nei 18 distretti del continente e nelle regioni autonome delle Azzorre e di Madeira, coprendo una media di 118 comuni a settimana.

A partire da giugno, l'INSA ha adottato una nuova strategia per il monitoraggio continuo della diversità genetica del nuovo coronavirus in Portogallo, che si basa su un campionamento settimanale a livello nazionale: "Questo approccio permetterà una migliore caratterizzazione genetica della SARS-CoV-2, poiché i dati saranno analizzati continuamente e non ci saranno più intervalli di tempo tra le analisi", sottolinea l'istituto.