Volgens het meest recente situatieverslag over de genetische diversiteit van SARS-CoV-2 in Portugal, dat door het INSA is gepubliceerd, is de Delta-variant, die aanvankelijk met India in verband werd gebracht, "dramatisch gestegen" in relatieve frequentie op nationaal niveau, maar is de verspreiding "nog steeds zeer heterogeen tussen de regio's".

Volgens het INSA varieert de verspreiding van de deltavariant van 3,2 procent (Azoren) tot 94,5 procent (Alentejo), maar gezien de trend die tussen mei en juni is waargenomen, "wordt verwacht dat deze variant in de komende weken op het gehele nationale grondgebied dominant zal worden".

Van het totale aantal tot op heden geanalyseerde sequenties van de Delta-variant hebben er 46 de aanvullende K417N-mutatie in het Spike-eiwit, aldus het instituut.

Hij benadrukt echter dat ongeveer 50 procent van deze gevallen beperkt is tot slechts twee lokale transmissieketens, wat erop wijst dat hun verspreiding in de gemeenschap nog beperkt is, met de relatieve frequentie van dit profiel (Delta+K417N) in de nationale steekproef juni 2,3 procent.

Volgens het verslag werd onder de nieuwe geanalyseerde sequenties de Alpha-variant (B.1.1.7), die aanvankelijk in verband werd gebracht met het Verenigd Koninkrijk, door sequencing gedetecteerd met een relatieve frequentie van 40,2 procent in de nationale steekproef van juni, waaruit blijkt dat de aanwezigheid in het hele land sterk is verminderd (88,4 procent in mei).

Echter, legt het INSA uit, "deze variant komt nog steeds het meest voor in de regio Noord (62,7 procent) en in de autonome regio's van de Azoren (96,8 procent) en Madeira (69,8 procent)".

Het verslag van het Ricardo Jorge-instituut meldt ook dat de relatieve frequentie van de Beta- (B.1.351) en Gamma- (P.1) varianten laag blijft, zonder opwaartse trend in de laatste steekproeven.

"Het is met name opmerkelijk dat de Beta-variant met een frequentie van 0,1 procent en in slechts twee regio's (Lissabon en Vale do Tejo en Região Autónoma da Madeira) werd gedetecteerd", zegt hij.

Volgens het document zijn tot op heden 9.846 sequenties van het genoom van het nieuwe coronavirus geanalyseerd, afkomstig van monsters die in meer dan 100 laboratoria, ziekenhuizen en instellingen, die 284 gemeenten in Portugal vertegenwoordigen, zijn verzameld.

Als onderdeel van de genomische surveillance die het INSA coördineert, zijn 1.087 sequenties verkregen uit de nationale bemonstering voor juni 2021, die plaatsvond van 2 tot 15 juni. Bij deze bemonstering waren laboratoria betrokken die verspreid waren over de 18 districten van het Portugese vasteland en de autonome regio's van de Azoren en Madeira, en hebben in totaal 131 gemeenten bestreken.