De afdeling Infectieziekten van het Nationaal Gezondheidsinstituut Ricardo Jorge (INSA) heeft al 13.256 sequenties van het genoom van het nieuwe coronavirus geanalyseerd, afkomstig van monsters die zijn verzameld in meer dan 100 laboratoria, ziekenhuizen en instellingen, die 297 gemeenten in Portugal vertegenwoordigen. "Van de nieuwe geanalyseerde sequenties is de Delta-variant (B.1.617.2) de meest voorkomende variant in Portugal met een frequentie van 98,3 procent in week 29 (19 tot 25 juli) en meer dan 95 procent in alle regio's", staat in het "Status report on the genetic diversity of the new SARS-CoV-2 coronavirus in Portugal" dat vandaag op de website van het INSA is gepubliceerd .

Volgens de gegevens bedroeg de relatieve frequentie van de Delta-variant in deze periode 100 procent in het noorden, de Algarve en de Autonome Regio Madeira, 97,6 procent in de regio's Centrum en Alentejo, 97,2 procent in Lissabon en Vale do Tejo en 95 procent in de Autonome Regio van de Azoren. De INSA-onderzoekers zeggen dat van het totale aantal tot op heden geanalyseerde sequenties van de Delta-variant er 62 de aanvullende K417N-mutatie in het Spike-eiwit hebben (sublijn AY.1). "Deze sublijn heeft sinds week 24 (14 tot 20 juni) een relatieve frequentie van minder dan 1 procent behouden, waarbij in de periode van week 28 (12 tot 18 en 29 juli) en week 29 (19 tot 25 juli) zes gevallen zijn vastgesteld. )", verwijzen zij.

Uit het verslag over de genetische diversiteit van SARS-CoV-2 blijkt ook dat de relatieve frequentie van de Beta-variant (B.1.351) en de Gamma-variant (P.1), die aanvankelijk met respectievelijk Zuid-Afrika en Brazilië (Manaus) in verband werden gebracht, blijft dalen en geen stijgende tendens vertoont. Beide hadden een frequentie van 0,4 procent in week 29, volgens de tot nu toe verzamelde gegevens, benadrukken zij, eraan toevoegend dat geen nieuwe gevallen van de Lambda-variant (C.37) werden ontdekt, die een duidelijke circulatie heeft in de regio's Peru en Chili.

Onder de andere interessante varianten die in Portugal circuleren, wijst het INSA op de varianten B.1.621, aanvankelijk ontdekt in Colombia, en Eta (B.1.525), aanvankelijk ontdekt in Nigeria, die mutaties in het Spike-eiwit hebben, die worden gedeeld met enkele van de verontrustende varianten. Deze varianten hebben een lage frequentie in Portugal, waar sinds week 25 (21 tot 27 juni) minder dan 0,8 procent (B.1.621) of 0,3 procent (Eta B.1.525) is gedetecteerd, aldus het document.

In het kader van de continue monitoring van de genetische diversiteit van SARS-CoV-2 die het INSA ontwikkelt, zijn sinds begin juni 2021 gemiddeld 601 sequenties per week geanalyseerd. Bij deze bemonstering waren laboratoria betrokken die verspreid waren over de 18 districten van het continent en de autonome regio's van de Azoren en Madeira, waarbij gemiddeld 118 gemeenten per week werden bestreken.

Vanaf juni heeft het INSA een nieuwe strategie goedgekeurd voor de continue monitoring van de genetische diversiteit van het nieuwe coronavirus in Portugal, die gebaseerd is op wekelijkse bemonstering in het hele land: "Deze aanpak zal een betere genetische karakterisering van SARS-CoV-2 mogelijk maken, aangezien de gegevens continu zullen worden geanalyseerd en er niet langer tijdsintervallen tussen de analyses zullen zijn", beklemtoont het instituut.