Согласно последнему отчету о генетическом разнообразии SARS-CoV-2 в Португалии, опубликованному INSA, дельта-вариант, первоначально ассоциировавшийся с Индией, продемонстрировал "резкий рост" относительной частоты на национальном уровне, но его распространение "по-прежнему очень неоднородно между регионами".

По данным INSA, распространение варианта Дельта варьируется от 3,2 процента (Азорские острова) до 94,5 процента (Алентежу), но с учетом тенденции, наблюдавшейся в мае-июне, "ожидается, что в ближайшие недели этот вариант станет доминирующим на всей территории страны".

Из общего числа последовательностей вариантов Delta, проанализированных на сегодняшний день, 46 имеют дополнительную мутацию K417N в белке Spike, сообщает институт.

Однако, подчеркивает он, около 50 процентов этих случаев ограничены всего двумя локальными цепями передачи, что говорит о том, что их циркуляция в сообществе все еще ограничена, а относительная частота этого профиля (Delta+K417N) в национальной выборке составляет 2,3 процента.

Согласно отчету, среди новых проанализированных последовательностей, вариант Alpha (B.1.1.7), первоначально ассоциированный с Великобританией, был обнаружен с помощью секвенирования с относительной частотой 40,2 процента в национальной выборке июня, что свидетельствует о сильном снижении посещаемости по всей стране (88,4 процента в мае).

Однако, объясняет INSA, "этот вариант по-прежнему наиболее распространен в Северном регионе (62,7 процента) и в автономных областях Азорские острова (96,8 процента) и Мадейра (69,8 процента)".

В отчете Института Рикардо Хорхе также сообщается, что относительная частота вариантов Бета (B.1.351) и Гамма (P.1) остается низкой, причем в последних выборках нет тенденции к росту.

"В частности, примечательно, что Бета-вариант был обнаружен с частотой 0,1 процента и только в двух регионах (Лиссабон и Вале-ду-Тежу и Автономный регион Мадейра)", - говорит он.

Согласно документу, на сегодняшний день проанализировано 9 846 последовательностей генома нового коронавируса, полученных из образцов, собранных в более чем 100 лабораториях, больницах и учреждениях, представляющих 284 муниципалитета Португалии.

В рамках геномного надзора, который координирует INSA, 1 087 последовательностей были получены в ходе национального отбора проб за июнь 2021 года, который проходил со 2 по 15 июня. В этом отборе участвовали лаборатории, расположенные в 18 районах материковой части Португалии и автономных регионах Азорских островов и Мадейры, охватывающих в общей сложности 131 муниципалитет.