Кафедра инфекционных болезней Национального института здравоохранения имени Рикардо Хорхе (INSA) уже проанализировала 13 256 последовательностей генома нового коронавируса, полученных из образцов, собранных в более чем 100 лабораториях, больницах и учреждениях, представляющих 297 муниципалитетов Португалии. "Среди новых проанализированных последовательностей вариант Delta (B.1..617.2) является наиболее распространенным вариантом в Португалии с частотой 98,3% на 29-й неделе (с 19 по 25 июля), превышающей 95% во всех регионах", - говорится в "Отчете о состоянии генетического разнообразия нового коронавируса SARS-CoV-2 в Португалии", опубликованном сегодня на сайте INSA .

Согласно данным, относительная частота варианта "Дельта" в этот период составила 100 процентов на севере, в Алгарве и автономном регионе Мадейра, 97,6 процента в регионе Центр и Алентежу, 97,2 процента в Лиссабоне и Вале-ду-Тежу и 95 процентов в автономном регионе Азорские острова. Исследователи INSA отмечают, что из общего числа проанализированных на сегодняшний день последовательностей вариантов Delta 62 имеют дополнительную мутацию K417N в белке Spike (подлиния AY.1). "Эта подлиния сохраняет относительную частоту ниже 1% с 24-й недели (с 14 по 20 июня), а шесть случаев были выявлены в период 28-й (с 12 по 18 и 29 июля) и 29-й (с 19 по 25 июля) недель. )", - отмечают они.

Отчет о генетическом разнообразии SARS-CoV-2 также указывает, что относительная частота вариантов Бета (B.1.351) и Гамма (P.1), первоначально ассоциированных с Южной Африкой и Бразилией (Манаус), соответственно, продолжает снижаться и не имеет тенденции к росту. Оба варианта имели частоту 0,4% на 29-й неделе, согласно данным, собранным на сегодняшний день, подчеркивают они, добавляя, что не было выявлено новых случаев варианта Лямбда (C.37), который отмечен циркуляцией в регионах Перу и Чили.

Среди других интересных вариантов, циркулирующих в Португалии, INSA выделяет варианты B.1.621, первоначально выявленный в Колумбии, и Eta (B.1.525), первоначально выявленный в Нигерии, которые имеют мутации в белке Spike, общие с некоторыми тревожными вариантами. Эти варианты имеют низкую частоту в Португалии, будучи обнаруженными на уровне менее 0,8 процента (B.1.621) или 0,3 процента (Eta B.1.525) с 25-й недели (с 21 по 27 июня), говорится в документе.

В рамках постоянного мониторинга генетического разнообразия SARS-CoV-2, который разрабатывает INSA, с начала июня 2021 года анализировалась в среднем 601 последовательность в неделю. В этой выборке участвовали лаборатории, распределенные по 18 округам континента и автономным областям Азорских островов и Мадейры, охватывая в среднем 118 муниципалитетов в неделю.

С июня INSA принял новую стратегию непрерывного мониторинга генетического разнообразия нового коронавируса в Португалии, которая основана на еженедельном общенациональном отборе проб. "Этот подход позволит лучше генетически охарактеризовать SARS-CoV-2, поскольку данные будут анализироваться непрерывно, и между анализами больше не будет временных интервалов", - подчеркивает институт.