里卡多-豪尔赫国家卫生研究所(INSA)的传染病部门已经分析了13256个新冠状病毒的基因组序列,这些序列是从代表葡萄牙297个城市的100多个实验室、医院和机构收集的样本中获得的。"在分析的新序列中,Delta变体(B.1.617.2)是葡萄牙最普遍的变体,在第29周(7月19日至25日)的频率为98.3%,在所有地区都高于95%",今天在INSA网站上发表的 "葡萄牙新SARS-CoV-2冠状病毒的遗传多样性现状报告 "指出。

根据该数据,在此期间,Delta变体的相对频率在北部、阿尔加维和马德拉自治区为100%,在中部和阿连特茹地区为97.6%,在里斯本和Vale do Tejo为97.2%,在亚速尔群岛自治区为95%。INSA的研究人员说,在迄今为止分析的全部Delta变体序列中,有62个具有刺突蛋白的额外K417N突变(AY.1亚系)。"自第24周(6月14日至20日)以来,该亚系一直保持着低于1%的相对频率,在第28周(7月12日至18日和29日)和第29周(7月19日至25日)期间检测到6例。)",他们提到。

SARS-CoV-2遗传多样性报告还表明,最初分别与南非和巴西(马瑙斯)有关的Beta(B.1.351)和Gamma(P.1)变体的相对频率保持下降,没有上升趋势。他们强调,根据迄今为止收集的数据,这两种变体在第29周的频率为0.4%,并补充说没有发现兰姆达变体(C.37)的新病例,该变体在秘鲁和智利地区有明显的流通。

在葡萄牙流通的其他相关变体中,INSA强调了最初在哥伦比亚检测到的变体B.1.621和最初在尼日利亚检测到的Eta(B.1.525),它们在刺突蛋白上有突变,与一些令人担忧的变体共享。该文件指出,这些变种在葡萄牙的频率很低,自第25周(6月21日至27日)以来,检测到的变种低于0.8%(B.1.621)或0.3%(Eta B.1.525)。

作为INSA正在开发的SARS-CoV-2遗传多样性的持续监测的一部分,自2021年6月初以来,平均每周分析601个序列。这一抽样涉及分布在非洲大陆18个区以及亚速尔和马德拉自治区的实验室,平均每周覆盖118个城市。

截至6月,国家统计局采取了一项新的战略,对葡萄牙新冠状病毒的遗传多样性进行持续监测,该战略基于每周的全国性抽样。该研究所强调说:"这种方法将使SARS-CoV-2的遗传特征得到更好的描述,因为数据将被连续分析,而且分析之间不再有时间间隔"。